Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C17orf47Q8NEP4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms