Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9G6

Putative UPF0607 protein FLJ37424, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N9G6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8N9G6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8N9G6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8N9G6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8N9G6 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8N9G6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8N9G6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8N9G6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8N9G6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8N9G6 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8N9G6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8N9G6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8N9G6 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8N9G6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8N9G6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8N9G6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8N9G6 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8N9G6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8N9G6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8N9G6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8N9G6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8N9G6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8N9G6 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8N9G6 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8N9G6 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8N9G6 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8N9G6 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8N9G6 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8N9G6 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8N9G6 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8N9G6 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8N9G6 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8N9G6 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8N9G6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8N9G6 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8N9G6 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8N9G6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8N9G6 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8N9G6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8N9G6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8N9G6 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q8N9G6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q8N9G6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q8N9G6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8N9G6 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8N9G6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8N9G6 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8N9G6 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8N9G6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8N9G6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8N9G6 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8N9G6 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8N9G6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8N9G6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8N9G6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8N9G6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8N9G6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8N9G6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8N9G6 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8N9G6 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8N9G6 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8N9G6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8N9G6 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8N9G6 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8N9G6 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8N9G6 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8N9G6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8N9G6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8N9G6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8N9G6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8N9G6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8N9G6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8N9G6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8N9G6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8N9G6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8N9G6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8N9G6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8N9G6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8N9G6 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8N9G6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8N9G6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8N9G6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8N9G6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8N9G6 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8N9G6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8N9G6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8N9G6 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8N9G6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8N9G6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8N9G6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8N9G6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8N9G6 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8N9G6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8N9G6 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8N9G6 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8N9G6 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8N9G6 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8N9G6 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8N9G6 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8N9G6 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms