Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms