Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms