Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HECW1Q76N89 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HECW1Q76N89 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HECW1Q76N89 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HECW1Q76N89 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HECW1Q76N89 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HECW1Q76N89 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HECW1Q76N89 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HECW1Q76N89 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HECW1Q76N89 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HECW1Q76N89 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HECW1Q76N89 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HECW1Q76N89 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HECW1Q76N89 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HECW1Q76N89 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HECW1Q76N89 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HECW1Q76N89 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HECW1Q76N89 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HECW1Q76N89 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HECW1Q76N89 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms