Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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USP43Q70EL4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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