Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms