Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms