Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms