Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF6Q6KF10 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms