Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDE2Q6IQ49 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms