Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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RTL6Q6ICC9 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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RTL6Q6ICC9 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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RTL6Q6ICC9 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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RTL6Q6ICC9 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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RTL6Q6ICC9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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