Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms