Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVS0

C1orf140, Putative uncharacterized protein C1orf140, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf140Q5VVS0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms