Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms