Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms