Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSPP1Q1MSJ5 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms