Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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