Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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SGCAQ16586 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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SGCAQ16586 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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SGCAQ16586 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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SGCAQ16586 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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SGCAQ16586 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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