Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms