Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms