Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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