Protein–RNA interactions for Protein: Q15652

JMJD1C, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 2,540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1CQ15652 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JMJD1CQ15652 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms