Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms