Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
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