Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms