Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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ITGA9Q13797 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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ITGA9Q13797 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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