Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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