Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms