Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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