Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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FOXE3Q13461 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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FOXE3Q13461 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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FOXE3Q13461 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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FOXE3Q13461 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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