Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms