Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms