Protein–RNA interactions for Protein: Q13094

LCP2, Lymphocyte cytosolic protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP2Q13094 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCP2Q13094 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms