Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
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TRAF1Q13077 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF1Q13077 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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