Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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