Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCB1Q12824 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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