Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms