Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms