Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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FAM27E3Q08E93 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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FAM27E3Q08E93 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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FAM27E3Q08E93 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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FAM27E3Q08E93 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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FAM27E3Q08E93 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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FAM27E3Q08E93 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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FAM27E3Q08E93 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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