Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CD47Q08722 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD47Q08722 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD47Q08722 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD47Q08722 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD47Q08722 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD47Q08722 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD47Q08722 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD47Q08722 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD47Q08722 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD47Q08722 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD47Q08722 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD47Q08722 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CD47Q08722 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD47Q08722 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CD47Q08722 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CD47Q08722 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD47Q08722 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD47Q08722 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CD47Q08722 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD47Q08722 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD47Q08722 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD47Q08722 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD47Q08722 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD47Q08722 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD47Q08722 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD47Q08722 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CD47Q08722 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD47Q08722 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD47Q08722 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD47Q08722 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD47Q08722 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD47Q08722 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD47Q08722 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD47Q08722 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD47Q08722 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD47Q08722 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD47Q08722 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD47Q08722 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD47Q08722 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD47Q08722 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD47Q08722 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD47Q08722 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD47Q08722 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD47Q08722 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD47Q08722 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD47Q08722 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD47Q08722 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD47Q08722 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD47Q08722 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD47Q08722 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CD47Q08722 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CD47Q08722 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD47Q08722 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD47Q08722 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD47Q08722 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD47Q08722 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD47Q08722 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD47Q08722 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD47Q08722 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD47Q08722 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD47Q08722 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD47Q08722 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD47Q08722 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD47Q08722 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD47Q08722 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD47Q08722 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD47Q08722 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD47Q08722 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD47Q08722 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD47Q08722 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD47Q08722 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD47Q08722 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD47Q08722 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD47Q08722 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD47Q08722 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD47Q08722 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD47Q08722 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD47Q08722 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD47Q08722 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD47Q08722 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD47Q08722 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD47Q08722 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD47Q08722 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD47Q08722 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD47Q08722 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD47Q08722 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD47Q08722 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD47Q08722 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD47Q08722 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD47Q08722 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD47Q08722 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD47Q08722 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD47Q08722 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD47Q08722 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD47Q08722 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD47Q08722 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD47Q08722 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD47Q08722 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD47Q08722 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms