Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DHX9Q08211 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms