Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4BQ07343 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4BQ07343 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms