Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 RLN2-201ENST00000381627 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AL591767.1-201ENST00000557160 568 ntTSL 4 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AC002558.2-201ENST00000572193 673 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 LINC00426-204ENST00000420219 1056 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 IL12A-205ENST00000480787 863 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AC010931.3-201ENST00000561647 554 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AL732372.1-203ENST00000635159 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms