Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms