Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIN1Q05586 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms