Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMX1Q04741 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms