Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms