Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN1Q04323 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms