Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms